vii

BioOptix™ 10
Tab le of Con ten ts

Section 1 Introduction

1.1 Product Overview . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1-1
1.2 System Specifications . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1-2
1.3 System Controls and Connectors. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1-3
1.3.1 BioOptix 10 Front Panel Controls . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1-3
1.3.2 BioOptix 10 Left-side Controls and Connections . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1-4
1.3.3 BioOptix 10 Right-side Connections . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1-5
1.3.4 BioOptix 10 Rear Panel Controls and Connections . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1-6

Section 2 Installation

2.1 Unpacking the BioOptix 10 System. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2-1
2.2 BioOptix 10 Installation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2-1
2.2.1 BioOptix 10 Location and Space Requirements . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2-1
2.2.2 Electrical Requirements . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2-2
2.2.3 Assembling the BioOptix 10 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2-2
2.2.4 Assembling the Foxy 200 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2-9
2.2.5 Fluid Connections . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2-10
2.2.6 Windows PC Connection . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2-14
2.3 BioOptix 10 Software Installation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2-14
2.3.1 Configuring BioOptix 10 Software . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2-14
2.4 BioOptix 10 System Preparation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 2-15

Section 3 Operation

3.1 Sample Preparation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3-1
3.2 Column Installation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3-1
3.2.1 Column Tubing and Adapters . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3-1
3.3 BioOptix 10 Software . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3-2
3.3.1 Overview . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3-2
3.4 Gradients. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3-2
3.4.1 Defining a Gradient . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3-3
3.4.2 Saving the Gradient . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3-3
3.5 Methods . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3-3
3.5.1 Equilibrate Settings . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3-4
3.5.2 Load Settings . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3-5
3.5.3 Wash Settings . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3-6
3.5.4 Elute Settings . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3-6
3.5.5 Flush Settings . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3-7
3.5.6 Saving the Method File . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3-7
3.6 Experiments . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3-7
3.6.1 Setting up the Experiment . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3-8
3.6.2 Editing the Experiment . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3-8
3.6.3 Saving the Experiment File . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3-9
3.7 Running the Experiment . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3-9
3.7.1 System Operation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3-9
3.7.2 Operation Displays . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3-10
3.7.3 Suspending System Operation . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3-10