Chapter 3 Peak Detection and Labeling

The following table lists the default settings in the .SET files provided for spectra.

 

 

 

Mariner

Voyager Spectrum

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Reflector

 

 

 

Parameter

Spectrum

Linear

PSD

 

 

MARINER.S

VOYAGER

 

 

 

VOYAGER

VOYAGER

 

 

 

ET

LINEAR.SET

REFLECTOR

PSD.SET

 

 

 

 

 

.SET

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Basic Settings (spectrum data)

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

%Base Peak Intensity

0.25

0

0

0

 

 

 

 

 

 

 

 

 

%Max Peak Area

0.25

2

2

2

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Use Resolution Dependent

ON

ON

ON

OFF

3

 

Settings

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Mass Resolution

5,000

2,000

10,000

N/A

 

 

Peak Processing

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Integration Baseline Setting

V-to-V

V-to-B

V-to-B

V-to-B

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Centroid%

50

50

50

50

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Max. Charge State

6

1

1

1

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Max. Isotopes#

6

5

10

5

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Min. Intensity%

5

10

10

10

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Max. Intensity%

100

100

100

100

 

 

 

 

 

 

 

3-72 Applied Biosystems